Warhammer 40,000: Rogue Trader zal vooral twee soorten spelers aanspreken. De eerste groep omvat fans van turn-based, tactische CRPG's, vooral die met een sterke focus op gevechten. De tweede groep bestaat uit Warhammer 40K-fans die dol zijn op het speluniversum en de lore ervan. Als je je ergens in deze doelgroep bevindt, zou Rogue Trader je nieuwe obsessie kunnen worden. Spelers die door Baldur's Gate 3 zijn overgestapt naar CRPG's, zullen een vergelijkbare, maar uitdagendere ervaring vinden in Rogue Trader.
Het proloog-tutorial van Rogue Trader leert de basisprincipes van beweging en gevechten en zet de toon voor het verhaal. Het introduceert de speler echter niet per se zachtjes in de diepe lore van Warhammer. In wezen ben je een buitenstaander in het systeem met een sterke wens om winst te maken. Het Menselijk Imperium geeft je een enorm schip en zijn zegen. Je taken omvatten het verkennen van de grenzen van het rijk, het ontdekken van nieuwe planeten, het opbouwen van handel en bondgenootschappen, en het verslaan van verzetsgroepen.